PCR引物设计的方法有多种，这里介绍一种简单易懂的方法。就以人的PTEN基因为例，首先你要找到他的基因序列，如果你要用的是cDNA，就找它的mRNA序列。如果你要做的是DNA，就找DNA的序列。
以cDNA为例，普遍的一种方法是上PUBMED中GENE栏搜索找到cDNA那栏，但PUBMED导出序列不太方便，我介绍个网站
http://asia.ensembl.org/index.html
1. 输入目的基因，进入
2.在左侧栏选择TRANSCRIPT，选择后进入
3. 选择PTEN-001中的TRANSCRIPT进入，点击左侧cDNA
4. 然后点击CONFIGURE THIS PAGE进入设置你要显示的内容
5. 除了第一栏SHOWEXONS选择YES外，其他的都选择NO，然后取个名字保存SAVE CONFIGURATION AS
6. 然后在左侧栏点击DOWNLOADVIEW AS RTF可下载你要的cDNA序列，这个文件可以用WORD打开，不同的颜色代表一个外显子间断
下载后打开的WORD
7. 然后根据可以根据你感兴趣的序列设计引物了，比如我在分别在第6和第7外显子分别设计上下游引物。选取并复制第6和第7外显子序列
8. 登陆 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/，粘贴这段序列，设置好RANGE和PCR产物的大小，然后在下面点击GET PRIMERS，可以在线设计并比对引物
9.最后选择一个比较特异性的引物，条带大小要尽量单一，其他的基因序列尽量不要比对到
